Pro vyšetření antigenu (Helicobacter pylori, Rota-Adeno-Noroviry, toxin cl. difficile) odebíráme stolici (cca 2 ml nebo kousek stolice velikosti lískového ořechu) umělohmotnou lopatičkou, která je součástí speciálního plastového kontejneru. Odešleme co nejdříve do laboratoře. Transport při teplotě v rozmezí 20–25 °C.
Vzorek se dá uchovávat při teplotě 4–8 °C 1-2 dny, optimální je vyšetřit vzorek do 4 hodin po odběru.